از آنجا که هر جامعه‌ای جهت رشد و اعتلای فرهنگ اصیل قرآنی و اسلامی نیازمند افرادی متخصص و کاردان در زمینه‌های مختلف علوم اسلامی است، با توجه به اقبال دانش‌آموختگان مدارس علوم دینی به دوره‌های تخصص تکمیلی، حوزه علمیه احناف خواف با الطاف خداوند متعال در سال تحصیلی جدید (۹۸-۹۷) نیز در دو بخش تفسیر قرآن مجید و فقه و فتوانویسی از فارغ‌التحصیلان واجد شرایط ثبت‌نام به عمل می‌آورد.

با توجه به انتشار خبر اخیر مبنی بر اظهارنظر یکی از روحانیون اهل سنت خواف که در فضای مجازی انتشار یافته و عکس‌العمل‌هایی به دنبال داشته است، دفتر حضرت مولانا مطهری - مدیریت محترم حوزه علمیه احناف خواف-  بیانیه‌ای به شرح ذیل منتشر نمود:

اطلاعیه

بدین وسیله به اطلاع عموم مردم دین دوست میرساند؛
مراسم تشییع جنازه مرحوم حضرت مولانا علی بایی ـ رحمه الله ـ فردا صبح (19آذر) ساعت 6:30 از میدان جهاد شهر تایباد به سمت مشهدریزه آغاز خواهد شد.
پیکر مطهر حضرت مولانا از میدان امام رضا (ورودی شهر) بر دستان مردم دین دوست تا حوزه علمیه دارالعلوم اسلامی ریزه تشییع و نماز جنازه ساعت ۱۰ صبح اقامه می‌گردد.
سپس پیکر ایشان جهت خاکسپاری به مزار شاهزاده قاسم منتقل می‌شود. "انوار وب"

حضرت مولانا مطهری - مدیر محترم حوزه علمیه احناف خواف - طی پیامی سخنان شبکه ولایت که اخیرا به حضرت شیخ الاسلام مولانا عبدالحمید توهین کرده بود را محکوم کردند.متن پیام بدین شرح است:

با پایان انتخابات ریاست جمهوری و اعلان نتایج آن و انتخاب دکتر حسن روحانی برای دومین بار به عنوان ریاست جمهوری اسلامی ایران، جناب مولانا مطهری پیام تبریکی صادر فرمودند که متن آن به شرح زیر است: